A Nintendo e a Activision aproveitaram o Nintendo Direct especial da E3 para anunciarem uma parceria muito especial, que vai permitir aos jogadores de Wii U desfrutarem de duas personagens muitos especiais em Skylanders Superchargers. Nessa versão do jogo será possível jogar com Bowser e Donkey Kong, desde que tenham os Amiibos especiais destas duas personagens, mais os respetivos veículos.
Através de um pequeno interruptor, as figuras podem ser usadas no formato de Skylanders, ou como figuras Amiibo normais.